免疫组和免疫组学的概念最早是在1999年由Pederson教授在奥斯陆举行的自身免疫国际会议上提出的，但当时Pederson教授的免疫组学的定义只局限于研究抗体和TCR V区分子结构与功能，随着人类基因组计划的完成，免疫组学的概念已远远超出了抗体和TCR的范畴，其新定义是研究免疫相关的全套分子库，它们的作用靶分子及其功能，免疫组学包括了免疫基因组学，免疫蛋白质组学和免疫信息学三方面的研究，特别强调在基因组学和蛋白质组学研究的基础上，充分利用生物信息学，生物芯片，系统生物学，结构生物学，高通量筛选等技术。

免疫组库（Immune Repertoire，IR）是指在任何指定时间，某个个体的循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的总和。免疫组库测序（Immune Repertoire sequencing(IR-SEQ)）是以 T/B 淋巴细胞为研究目标，用多重PCR技术扩增决定B细胞受体（BCR）或T细胞受体（TCR）多样性的互补决定区（CDR3区），再结合高通量测序技术，全面评估免疫系统的多样性，深入挖掘免疫组库与疾病的关系。

TCRβ CDR3表达特征可作为区分乙肝、肝癌亚型的生物标志物。研究发现，T细胞与肿瘤的预后和发展有密切的关系。文章选取160个RNA样品（分别取自健康人、乙肝病人、三种亚型肝癌病人、结肠癌病人），多重PCR扩增TCRβ CDR3区域，分析TCRβ在不同群体中的表达特征。研究发现，癌症病人的TCRβ很相似，与健康人完全不同。而HCC、ICC、MHC病人的TCRβ有差异，可用于区分健康人、肝癌、乙肝病人。

    研究内容

 一、标准信息分析

1、基本数据统计

数据过滤，对原始数据进行去除接头污染序列及低质量reads的处理

数据搭建，数据拼接，消除测序背景及有效数据构建

数据统计，数据产出统计及测序数据的成分和质量评估

2、数据比对分析

比对分析，与数据库（IMGT）V/D/J基因片段比对

重新比对，寻找最佳V/D/J比对结果

3、序列结构分析

分析CDR序列组成及序列碱基成分

分析CDR序列的碱基插入和缺失

编码CDR序列翻译成氨基酸和肽链

4、免疫组库构建